À Florence, à la fin du xv^e siècle.

Depuis la chute de la maison Médicis, les esprits sont prompts à s'échauffer entre les défenseurs du régime républicain en place, et les partisans d'un retour au pouvoir aristocratique. Quand des cadavres atrocement mutilés sont découverts, les dirigeants accusent d'emblée le charismatique évêque Savonarole de conduire la ville à sa perte.

Témoin d'un des meurtres, Niccolò Machiavel, jeune secrétaire de chancellerie, va mettre à profit ses parfaites connaissances de l'âme humaine et des rouages politiques pour mener une enquête qui le plonge au coeur d'un complot visant à renverser la République. Mais ne cherche-t-il pas d'abord à servir ses intérêts ?

Secondé par quelques amis, il part à la recherche d'un mystérieux moine ; cependant, au fil des événements, c'est son propre passé qui va refaire surface.